ในจังหวัดมิคาโดะ (ญี่ปุ่น: 三門市 โรมาจิ: Mikado-shi) ที่มีประชากร 28,000 คน ประตูของโลกต่างมิติหรือ "เกท" ได้เปิดขึ้น สิ่งมีชีวิตที่เรียกว่า "เนเบอร์" (ญี่ปุ่น: 近界民（ネイバー） โรมาจิ: Neibā) ได้ปรากฏตัวออกมาจากเกท ทั่วเมืองตกอยู่ในความหวาดหวั่นเพราะไม่มีอาวุธใดๆบนโลกที่จัดการกับพวกมันได้ แต่ก็มีการปรากฏตัวของกลุ่มบุคคลลึกลับที่เข้าต่อสู้กับเหล่าเนเบอร์ คือ กองกำลังป้องกันพรมแดนโลกหรือ "บอเดอร์" ซึ่งได้พัฒนาเทคโนโลยีที่ใช้ป้องกันเนเบอร์ และได้สร้างฐานทัพขึ้นเพื่อต่อต้านเนเบอร์ สี่ปีต่อมาหลังจากที่เกทเปิดเป็นครั้งแรก คูงะ ยูมะ (ญี่ปุ่น:  โรมาจิ: 空閑 遊真 ทับศัพท์: Kuga Yūma) เนเบอร์ที่มีรูปลักษณ์เป็นมนุษย์ ได้มาที่จังหวัดมิคาโดะ แล้วได้พบกับมิคุโมะ โอซามุ (ญี่ปุ่น: 三雲 修 โรมาจิ: Mikumo Osamu) นักเรียนมัธยมต้นที่เป็นสมาชิกของบอร์เดอร์